Data specificaties

Geospatial rasters

Alle geospatial rasters die aangeboden worden aan MNP worden verondersteld:

  • geprojecteerd te zijn in het RD-New (epsg:28992) coordinatenstelsel

  • dezelfde extent te hebben in RD-New (meestal, maar niet perse: left: 0 bottom: 300.000 right: 280.000 top: 625.000)

Voor het Land-type raster wordt verondersteld:

  • 2.5 m resolutie

  • unsigned integer datatype

Voor Environmental factor rasters wordt verondersteld:

  • 25 m resolutie

  • floating point datatype

MNP werkt het beste met het Geotiff bestandsformaat, maar andere gdal raster drivers werken waarschijnlijk ook. Dit is niet getest.

CSV tabellen

Alle input en output tabellen van MNP gebruiken het *.csv bestandstype. CSV is een open source bestandstype dat door alle gangbare teksteditors en MS Excel gelezen kan worden.

Een *.csv bestand is opgebouwd uit rijen en kolommen. De kolommen worden gescheiden door een komma (,) en elke rij staat op een nieuwe regel. De eerste rij wordt verondersteld de kolomnamen te bevatten

Land type raster legenda tabel

Een *.csv tabel die dient als legenda voor het land-type raster, met de volgende opbouw:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

land_type_code

Unieke code ter identificatie van het land-type

-

-

string

False

land_type_name

Naam van het land-type

-

-

string

False

land_type_id

Getal waarmee dit land-type wordt aangeduid in het land-type raster

-

1-∞

integer

False

MNP verwacht dat alle land_type_codes even lang zijn.

Aanvullende kolommen met bijvoorbeeld arealen per land-type zijn toegestaan, maar worden genegeerd.

Gebruikelijk is om de SNL Natuurbeheertypen als land-type categorisatie te gebruiken. In dat geval wordt de Beheertype code zoals N04.04 gebruikt als land_type_code en de Beheertype naam Afgesloten zeearm als land_type_name.

Land type suitability index tabel

Een *.csv tabel waarin de soorten gekoppeld worden aan de land-types middels een suitability index tussen 0-1. In de praktijk wordt een waarde van 0 weggelaten uit de tabel. De opbouw is:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

species_code

Unieke code ter identifcatie van de soort

-

-

string

False

land_type_code

Unieke code ter identificatie van het land-type

-

-

string

False

suitability_index

Geschiktheid van dit land-type voor deze soort

-

0-1

float

False

Environmental factor suitability index tabel

Een *.csv tabel waarin de respons (de suitability index) van de soorten richting de Environmental Variable wordt vastgelegd. De suitability index wordt trapsgewijs opgebouwd aan de hand van drempelwaarden van de Environmental Variable:

Suitability index

Environmental Variable waarde

0.0

waarde < percentile_05

0.5

percentile_05 ≤ waarde < percentile_25

1.0

percentile_25 ≤ waarde < percentile_75

0.5

percentile_75 ≤ waarde < percentile_95

0.0

waarde > percentile_95

De suitability index waardes (hier 0, 0.5 en 1) staan niet vast, maar worden opgegeven als parameter. Zie sectie parameters.

De suitability index tabel is als volgt opgebouwd:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

species_code

Unieke code ter identifcatie van de soort

-

-

string

False

percentile_05

drempelwaarde van de Environmental Variable

gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable

-∞ - ∞

float

False

percentile_25

drempelwaarde van de Environmental Variable

gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable

-∞ - ∞

float

False

percentile_75

drempelwaarde van de Environmental Variable

gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable

-∞ - ∞

float

False

percentile_95

drempelwaarde van de Environmental Variable

gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable

-∞ - ∞

float

False

Species names tabel

Deze *.csv tabel bevat referentiegegevens van mogelijke doelsoorten. Een opgegeven soort wordt door MNP als valide beschouwd als deze genoemd wordt in deze tabel. De opbouw van de tabel is:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

species_code

Unieke code ter identifcatie van de soort

-

-

string

False

scientific_name

Latijnse naam van de soort

-

-

string

False

local_name

Nederlandse naam van de soort

-

-

string

False

Species traits tabel

In deze *.csv tabel worden de soort specifieke eigenschappen (traits) vastgelegd. De opbouw is:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

species_code

Unieke code ter identifcatie van de soort

-

-

string

False

local_distance

afstand om patches een lokale populatie te clusteren

meter

0-∞

float

False

key_population_area

oppervlakte van een keypopulation

hectare

0-∞

float

False

group_traits_code

code van soortgroep

-

-

string

False

environmental_factor_formula

formule voor de combinatie van relevante environmental-variables tot de omgevingsfactor

-

-

string

False

land_type_procedure

strategie voor de interpretatie van de land-types kaart

-

-

string

False

De kolom abiotic formula omschrijft hoe de verschillende Environmental Variables gecombineerd dienen te worden tot een enkele environmental variable factor-waarde. Hierbij wordt gebruikt gemaakt van de opgegeven name van de Environmental Variables, hoewel er in de formule ook Environmental Variables genoemd mogen worden die niet opgegeven worden door de gebruiker.

Toegestane berekeningen op de Environmental Variables zijn:

  • vermenigvuldiging: e.g. ph*gvg*ndep

  • minimum: e.g. min(ph, gvg)

  • combinaties: e.g. min(ph, gvg*ndep), ndep*min(ph, gvg)

De kolom Land type procedure benoemt de procedure voor de interpretatie van de land-type kaart richting elke soort. Op dit moment alleen de nature procedure geimplementeerd, wat betekent dat de land-types direct aan soorten gekoppeld worden middels de land type suitability indexes tabel.

Het MNP model kan uitgebreid worden met alternatieve procudures, bijvoorbeeld een procedure om beheersmaatregelen in beschouwing te nemen. Zodra er meerdere procedures beschikbaar zijn, kan ik deze kolom worden aangegeven welke procedure van toepassing is per soort.

Group traits tabel

In deze *.csv tabel worden soortgroepen gedefinieerd en eigenschappen van elke groep vastgelegd:

Field

Description

Dimension

Range

Type

Null allowed

group_code

Unieke code van de groep

-

-

string

False

group_name

Unieke naam van de groep

-

-

string

False

possibly_viable_threshold

drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort possibly viable te laten zijn

-

0-∞

False

viable_threshold

drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort viable te laten zijn

-

0-∞

False

Soortgroepen kunnen door de gebruiker uitgewerkt en geimplementeerd worden. Een gebruikelijke indeling is:

  • Evertebraten, code E

  • Vertrebraten, code V

  • Planten, code P

Species selection tabel

Een *.csv tabel waarvan alleen de eerste kolom wordt ingelezen, andere kolommen worden genegeerd. De kolomnaam van de eerste kolom is niet relevant. De inhoud van de eerste kolom mag bestaan uit (een mix van):

  • species codes

  • species scientific names

  • species local names

Een voorbeeld van een species subselection tabel is:

species_identifier

S02000950

S02001040

Allium oleraceum

Vingerzegge

Ruig schapengras

Vals heideblauwtje

S09000222

Chalcolestes viridis

Dubbelingen in de tabel worden automatisch verwijderd (in dit voorbeeld S09000222 en Vingerzegge). Opgaves die niet genoemd worden in de species names tabel (in dit geval Chalcolestes viridis) worden genegeerd.

Relaties tussen input tabellen

schema van inputtabellen, kolomnamen en relaties

Detailed tabel in subselection output

In deze tabel staan alle resultaten van alle soorten in de soortselectie. De kolommen zijn:

Field

Description

Dimension

Range

Type

species_code

Unieke code ter identifcatie van de soort

-

-

string

scientific_name

Latijnse naam van de soort

-

-

string

local_name

Nederlandse naam van de soort

-

-

string

group_name

naam van de groep waartoe de soort behoort, ref group_traits tabel

-

-

string

key_population_area_ha

oppervlakte van een keypopulation, ref species_traits tabel

hectare

0-∞

float

possibly_viable_threshold

drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort possibly viable te laten zijn, ref group_traits tabel

hectare

0-∞

integer

viable_threshold

drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort viable te laten zijn, ref group_traits tabel

hectare

0-∞

integer

populations

aantal populaties van de soort

aantal

0-∞

integer

total_effective_area_m

effectief areaal in vierkante meter, alle populaties gesommeerd

m^2

0-∞

float

total_effective_area_kp

effectief areaal in sleutelpopulaties, alle populaties gesommeerd

sleutelpopulaties

0-∞

float

total_normalised_key_populations

effectief areaal in genormaliseerde sleutelpopulaties, alleen sleutelpopulaties gesommeerd

normkeys

0-∞

float

viability_class

duurzaamheidsklasse

-

1,2,3

integer

viability_class_description

omschrijving van de duurzaamheidsklasse

-

not viable, possibly viable, viable

string