Data specificaties

Geospatial rasters

Alle geospatial rasters die aangeboden worden aan MNP worden verondersteld:

• geprojecteerd te zijn in het RD-New (epsg:28992) coordinatenstelsel

• dezelfde extent te hebben in RD-New (meestal, maar niet perse: left: 0 bottom: 300.000 right: 280.000 top: 625.000)

Voor het Land-type raster wordt verondersteld:

• 2.5 m resolutie

• unsigned integer datatype

Voor Environmental factor rasters wordt verondersteld:

• 25 m resolutie

• floating point datatype

MNP werkt het beste met het Geotiff bestandsformaat, maar andere gdal raster drivers werken waarschijnlijk ook. Dit is niet getest.

CSV tabellen

Alle input en output tabellen van MNP gebruiken het *.csv bestandstype. CSV is een open source bestandstype dat door alle gangbare teksteditors en MS Excel gelezen kan worden.

Een *.csv bestand is opgebouwd uit rijen en kolommen. De kolommen worden gescheiden door een komma (,) en elke rij staat op een nieuwe regel. De eerste rij wordt verondersteld de kolomnamen te bevatten

Land type raster legenda tabel

Een *.csv tabel die dient als legenda voor het land-type raster, met de volgende opbouw:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
land_type_code	Unieke code ter identificatie van het land-type	-	-	string	False
land_type_name	Naam van het land-type	-	-	string	False
land_type_id	Getal waarmee dit land-type wordt aangeduid in het land-type raster	-	1-∞	integer	False

MNP verwacht dat alle land_type_codes even lang zijn.

Aanvullende kolommen met bijvoorbeeld arealen per land-type zijn toegestaan, maar worden genegeerd.

Gebruikelijk is om de SNL Natuurbeheertypen als land-type categorisatie te gebruiken. In dat geval wordt de Beheertype code zoals N04.04 gebruikt als land_type_code en de Beheertype naam Afgesloten zeearm als land_type_name.

Land type suitability index tabel

Een *.csv tabel waarin de soorten gekoppeld worden aan de land-types middels een suitability index tussen 0-1. In de praktijk wordt een waarde van 0 weggelaten uit de tabel. De opbouw is:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
species_code	Unieke code ter identifcatie van de soort	-	-	string	False
land_type_code	Unieke code ter identificatie van het land-type	-	-	string	False
suitability_index	Geschiktheid van dit land-type voor deze soort	-	0-1	float	False

Environmental factor suitability index tabel

Een *.csv tabel waarin de respons (de suitability index) van de soorten richting de Environmental Variable wordt vastgelegd. De suitability index wordt trapsgewijs opgebouwd aan de hand van drempelwaarden van de Environmental Variable:

Suitability index	Environmental Variable waarde
0.0	waarde < percentile_05
0.5	percentile_05 ≤ waarde < percentile_25
1.0	percentile_25 ≤ waarde < percentile_75
0.5	percentile_75 ≤ waarde < percentile_95
0.0	waarde > percentile_95

De suitability index waardes (hier 0, 0.5 en 1) staan niet vast, maar worden opgegeven als parameter. Zie sectie parameters.

De suitability index tabel is als volgt opgebouwd:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
species_code	Unieke code ter identifcatie van de soort	-	-	string	False
percentile_05	drempelwaarde van de Environmental Variable	gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable	-∞ - ∞	float	False
percentile_25	drempelwaarde van de Environmental Variable	gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable	-∞ - ∞	float	False
percentile_75	drempelwaarde van de Environmental Variable	gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable	-∞ - ∞	float	False
percentile_95	drempelwaarde van de Environmental Variable	gelijk aan de eenheid van de Environmental Variable	-∞ - ∞	float	False

Species names tabel

Deze *.csv tabel bevat referentiegegevens van mogelijke doelsoorten. Een opgegeven soort wordt door MNP als valide beschouwd als deze genoemd wordt in deze tabel. De opbouw van de tabel is:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
species_code	Unieke code ter identifcatie van de soort	-	-	string	False
scientific_name	Latijnse naam van de soort	-	-	string	False
local_name	Nederlandse naam van de soort	-	-	string	False

Species traits tabel

In deze *.csv tabel worden de soort specifieke eigenschappen (traits) vastgelegd. De opbouw is:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
species_code	Unieke code ter identifcatie van de soort	-	-	string	False
local_distance	afstand om patches een lokale populatie te clusteren	meter	0-∞	float	False
key_population_area	oppervlakte van een keypopulation	hectare	0-∞	float	False
group_traits_code	code van soortgroep	-	-	string	False
environmental_factor_formula	formule voor de combinatie van relevante environmental-variables tot de omgevingsfactor	-	-	string	False
land_type_procedure	strategie voor de interpretatie van de land-types kaart	-	-	string	False

De kolom abiotic formula omschrijft hoe de verschillende Environmental Variables gecombineerd dienen te worden tot een enkele environmental variable factor-waarde. Hierbij wordt gebruikt gemaakt van de opgegeven name van de Environmental Variables, hoewel er in de formule ook Environmental Variables genoemd mogen worden die niet opgegeven worden door de gebruiker.

Toegestane berekeningen op de Environmental Variables zijn:

• vermenigvuldiging: e.g. ph*gvg*ndep

• minimum: e.g. min(ph, gvg)

• combinaties: e.g. min(ph, gvg*ndep), ndep*min(ph, gvg)

De kolom Land type procedure benoemt de procedure voor de interpretatie van de land-type kaart richting elke soort. Op dit moment alleen de nature procedure geimplementeerd, wat betekent dat de land-types direct aan soorten gekoppeld worden middels de land type suitability indexes tabel.

Het MNP model kan uitgebreid worden met alternatieve procudures, bijvoorbeeld een procedure om beheersmaatregelen in beschouwing te nemen. Zodra er meerdere procedures beschikbaar zijn, kan ik deze kolom worden aangegeven welke procedure van toepassing is per soort.

Group traits tabel

In deze *.csv tabel worden soortgroepen gedefinieerd en eigenschappen van elke groep vastgelegd:

Field	Description	Dimension	Range	Type	Null allowed
group_code	Unieke code van de groep	-	-	string	False
group_name	Unieke naam van de groep	-	-	string	False
possibly_viable_threshold	drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort possibly viable te laten zijn	-	0-∞	False
viable_threshold	drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort viable te laten zijn	-	0-∞	False

Soortgroepen kunnen door de gebruiker uitgewerkt en geimplementeerd worden. Een gebruikelijke indeling is:

• Evertebraten, code E

• Vertrebraten, code V

• Planten, code P

Species selection tabel

Een *.csv tabel waarvan alleen de eerste kolom wordt ingelezen, andere kolommen worden genegeerd. De kolomnaam van de eerste kolom is niet relevant. De inhoud van de eerste kolom mag bestaan uit (een mix van):

• species codes

• species scientific names

• species local names

Een voorbeeld van een species subselection tabel is:

species_identifier
S02000950
S02001040
Allium oleraceum
Vingerzegge
Ruig schapengras
Vals heideblauwtje
S09000222
Chalcolestes viridis

Dubbelingen in de tabel worden automatisch verwijderd (in dit voorbeeld S09000222 en Vingerzegge). Opgaves die niet genoemd worden in de species names tabel (in dit geval Chalcolestes viridis) worden genegeerd.

Relaties tussen input tabellen

Detailed tabel in subselection output

In deze tabel staan alle resultaten van alle soorten in de soortselectie. De kolommen zijn:

Field	Description	Dimension	Range	Type
species_code	Unieke code ter identifcatie van de soort	-	-	string
scientific_name	Latijnse naam van de soort	-	-	string
local_name	Nederlandse naam van de soort	-	-	string
group_name	naam van de groep waartoe de soort behoort, ref group_traits tabel	-	-	string
key_population_area_ha	oppervlakte van een keypopulation, ref species_traits tabel	hectare	0-∞	float
possibly_viable_threshold	drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort possibly viable te laten zijn, ref group_traits tabel	hectare	0-∞	integer
viable_threshold	drempelwaarde voor aantal normkeys om de soort viable te laten zijn, ref group_traits tabel	hectare	0-∞	integer
populations	aantal populaties van de soort	aantal	0-∞	integer
total_effective_area_m	effectief areaal in vierkante meter, alle populaties gesommeerd	m^2	0-∞	float
total_effective_area_kp	effectief areaal in sleutelpopulaties, alle populaties gesommeerd	sleutelpopulaties	0-∞	float
total_normalised_key_populations	effectief areaal in genormaliseerde sleutelpopulaties, alleen sleutelpopulaties gesommeerd	normkeys	0-∞	float
viability_class	duurzaamheidsklasse	-	1,2,3	integer
viability_class_description	omschrijving van de duurzaamheidsklasse	-	not viable, possibly viable, viable	string